לחדר מכונות עם מסנן דיאטומי יש יתרונות מובהקים. ראשית, למסנן הדיאטומי יש יכולות סינון מרשימות. הוא מסנן חלקיקים בגודל 3 מיקרון, לעומת מסנני חול הלוכדים חלקיקים בגודל 20 מיקרון. בתוך המסנן הדיאטומי מותקנות מניפות בדים צפופים המחופים באבקה דיאטומית. גרגירי האבקה הדיאטומית מתאפיינוים במבנה ייחודי בעל בליטות המאפשרות את לכידת החלקיקים במי בריכת השחייה. שנית, התקנת מסנן דיאטומי מהווה פתרון לשטחים קטנים מאחר ומידותיו קטנות באופן יחסי למסנני חול. בנוסף, מבנה המסנן מאפשר גם חיסכון במים בזמן שטיפת המסנן מעת לעת.